למכללת ליפשיץ יש תפקיד מרכזי בעיצוב דרכו של החינוך הדתי-הציוני בישראל. בשורותיה למדו ולימדו מגדולי המחנכים והוגי הדעות של הציבור הדתי לאומי, וגם היום היא ממלאת את ייעודה כבית היוצר להגותו הייחודית של החינוך הממלכתי דתי בישראל ושל החינוך היהודי בעולם. המכללה מקיפה מגוון רחב של חוגי לימוד אקדמיים ומכשירה מורים ליהדות ולמדעים כדברי מרן הראי"ה קוק בטקס חנוכת בית מדרשנו (בשנת תרפ"א): "במוסד זה ישנה מזיגה בין קודש וחול... יעזור ה' שהמזיגה הזאת תתקיים באופן הנעלה ביותר בבית הזה".
המרכז להגות בחינוך היהודי הוקם בשנת תשנ"ה כיוזמה משותפת של מכללת ליפשיץ ומנהל החינוך הדתי במגמה להדגיש את מרכזיות מימד ההגות בשיח החינוכי ובהכשרה של בכירי המחנכים בחינוך היהודי.